Pelajaran 1Metode pengujian sensitivitas antimikroba (AST): difusi cakram, mikrodilusi kaldu, sistem AST otomatis — keunggulan, keterbatasan, kapan menggunakan masing-masingBagian ini membandingkan difusi cakram, mikrodilusi kaldu, strip gradien, dan sistem AST otomatis, menekankan pemilihan uji, pengaturan, pembacaan, kontrol kualitas, dan pengenalan mekanisme resistensi yang mungkin terlewat oleh metode tertentu.
Pengaturan, pembacaan, dan keterbatasan difusi cakramMikrodilusi kaldu dan penentuan MICStrip difusi gradien: penggunaan dan peringatanPlatform AST otomatis dan aturan peringatanMemilih metode AST untuk organisme khususPelajaran 2Kontrol kualitas, validasi, dan pertimbangan biosafety untuk pengujian molekulerBagian ini menguraikan kontrol kualitas, validasi, dan biosafety untuk pengujian molekuler, termasuk verifikasi asesai baru, QC rutin, pencegahan kontaminasi, pemisahan alur kerja, dan kepatuhan dengan standar regulasi dan akreditasi.
Verifikasi dan validasi asesai PCR baruKontrol internal, eksternal, dan proficiencyMencegah kontaminasi amplikom dan carryoverAlur kerja searah dan zonasi labPersyaratan regulasi dan akreditasiPelajaran 3Pendekatan generasi berikutnya: sekuensing amplikom target, langkah pipeline sekuensing genom utuh (WGS), perakitan, anotasi, pemanggilan gen resistensiBagian ini memperkenalkan sekuensing generasi berikutnya untuk pengawasan resistensi, menguraikan alur kerja amplikon target, persiapan library WGS, sekuensing, perakitan, anotasi, pemanggilan gen resistensi, dan langkah kontrol kualitas serta manajemen data dasar.
Desain amplikon target dan persiapan libraryPersiapan library WGS, pengindeksan, dan pengaturan runKontrol kualitas baca dan pilihan perakitan genomAnotasi genom dan database gen resistensiMelaporkan temuan NGS dan relevansi klinisPelajaran 4Penanganan spesimen dan kultur: set kultur darah, inkubasi, media subkultur dan petunjuk morfologi koloniBagian ini menjelaskan praktik terbaik untuk penerimaan spesimen, pengumpulan dan inkubasi kultur darah, teknik subkultur, dan interpretasi morfologi koloni, menghubungkan fitur makroskopik dengan patogen potensial dan pola kontaminasi.
Variabel pra-analitik dan penolakan spesimenAturan pengumpulan dan inkubasi set kultur darahPemilihan media subkultur dan pola inokulasiMembaca plat dan mengenali kultur campuranPetunjuk morfologi koloni untuk patogen umumPelajaran 5Metode fenotipik cepat dan asesai imunokromatografi untuk karbapenemase umumBagian ini fokus pada deteksi karbapenemase fenotipik cepat, termasuk varian Carba NP dan asesai alur lateral imunokromatografi, dengan penekanan pada karakteristik performa, integrasi alur kerja, dan interpretasi hasil dalam konteks klinis.
Prinsip asesai karbapenemase fenotipik cepatCarba NP dan turunannya: pengaturan dan readoutUji imunokromatografi untuk KPC, NDM, OXA-48Sensitivitas, spesifisitas, dan interferensi umumPenggunaan algoritmik dengan kultur dan uji molekulerPelajaran 6Metode identifikasi organisme: panel biokimia, alur kerja dan interpretasi MALDI-TOF MSBagian ini meninjau strategi identifikasi organisme utama, termasuk panel biokimia dan MALDI-TOF MS, mencakup persiapan sampel, alur kerja instrumen, interpretasi spektral, pemecahan masalah, dan integrasi dengan sistem informasi laboratorium.
Desain dan interpretasi panel identifikasi biokimiaPersiapan sampel MALDI-TOF untuk bakteri dan jamurParameter akuisisi dan kontrol kualitas spektralPencocokan database, cutoff skor, dan pelaporanKesalahan umum dan resolusi ID yang tidak sesuaiPelajaran 7Asesai fenotipik untuk deteksi resistensi: uji konfirmasi ESBL, uji Hodge modifikasi, Carba NP / mCIM / sCIM untuk karbapenemase, skrining AmpCBagian ini meninjau asesai fenotipik untuk resistensi, termasuk uji konfirmasi ESBL, skrining AmpC, dan asesai karbapenemase seperti mCIM, sCIM, dan Carba NP, dengan panduan algoritma dan interpretasi pola kompleks.
Skrining ESBL dan uji sinergi konfirmasiDeteksi fenotipik AmpC dimediasi plasmidAlur kerja dan interpretasi mCIM dan sCIMCarba NP dan asesai karbapenemase terkaitMengintegrasikan temuan fenotipik dan genotipikPelajaran 8Alur kerja molekuler: asesai PCR target untuk blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, metiltransferase 16SBagian ini membahas alur kerja molekuler untuk gen resistensi kunci, merinci desain asesai, kontrol, dan interpretasi untuk blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, dan metiltransferase 16S, ditambah integrasi dengan data sensitivitas fenotipik.
Desain primer dan probe untuk target resistensiMetode ekstraksi DNA dan kontrol inhibisiStrategi asesai PCR singleplex vs multiplexInterpretasi hasil dan batas deteksiMenyelesaikan hasil PCR dengan fenotipe ASTPelajaran 9Menginterpretasikan MIC dan breakpoint: perbedaan CLSI vs EUCAST dan cara memilih breakpoint tepatBagian ini menjelaskan interpretasi MIC menggunakan breakpoint CLSI dan EUCAST, menyoroti perbedaan konseptual, pembaruan, breakpoint spesifik dosis, dan strategi memilih serta mendokumentasikan standar tepat di laboratorium klinis.
Konsep MIC, ECOFF, dan breakpoint klinisPerbedaan utama antara CLSI dan EUCASTBreakpoint spesifik dosis dan situs infeksiPembaruan dan kontrol versi standarMendokumentasikan pilihan breakpoint di lab
