Somo 1Mbinu za vipimo vya unyonyaji wa antimicrobial (AST): diffusion ya diski, broth microdilution, mifumo ya AST ya kiotomatiki — faida, mapungufu, wakati wa kutumia kila mojaSehemu hii inalinganisha diffusion ya diski, broth microdilution, vipande vya gradient, na mifumo ya AST ya kiotomatiki, ikisisitiza uchaguzi wa vipimo, usanidi, kusoma, udhibiti wa ubora, na kutambua tarabu za upinzani ambazo zinaweza kukosekana na mbinu maalum.
Usanidi wa diffusion ya diski, kusoma, na mapungufuBroth microdilution na uamuzi wa MICVipande vya diffusion ya gradient: matumizi na maoniJukwaa za AST za kiotomatiki na sheria za tahadhariKuchagua mbinu za AST kwa viumbe maalumSomo 2Udhibiti wa ubora, uthibitisho, na mazingatio ya usalama wa kibayolojia kwa vipimo vya kimolekuliSehemu hii inafafanua udhibiti wa ubora, uthibitisho, na usalama wa kibayolojia kwa vipimo vya kimolekuli, ikijumuisha uthibitisho wa vipimo vipya, QC ya kawaida, kuzuia uchafuzi, kutenganisha mtiririko wa kazi, na kufuata viwango vya udhibiti na uthibitisho.
Uthibitisho na uthibitishaji wa vipimo vipya vya PCRUdhibiti wa ndani, nje, na ustadiKuzuia uchafuzi wa amplicon na carryoverMtiririko wa kazi wa upande mmoja na zoning ya maabaraMahitaji ya udhibiti na uthibitishoSomo 3Mbinu za kizazi kijacho: mfululizo wa amplicon uliolengwa, hatua za pipeline ya mfululizo wa genomu mzima (WGS), uunganishaji, maelezo, simu za jeni za upinzaniSehemu hii inatanguliza mfululizo wa kizazi kijacho kwa uchunguzi wa upinzani, ikifafanua mtiririko wa amplicon uliolengwa, maandalizi ya maktaba ya WGS, mfululizo, uunganishaji, maelezo, simu za jeni za upinzani, na hatua za msingi za udhibiti wa ubora na udhibiti wa data.
Muundo wa amplicon uliolengwa na maandalizi ya maktabaMaandalizi ya maktaba ya WGS, indexing, na usanidi wa runUdhibiti wa ubora wa kusoma na chaguzi za uunganishaji wa genomuMaelezo ya genomu na hifadhidata za jeni za upinzaniKuripoti matokeo ya NGS na umuhimu wa klinikiSomo 4Utunzaji wa sampuli na utamaduni: seti za utamaduni wa damu, incubation, media za subculture na ishara za morphology ya koloniSehemu hii inaelezea mazoea bora ya kupokea sampuli, kukusanya na incubation ya utamaduni wa damu, mbinu za subculture, na tafsiri ya morphology ya koloni, ikiuunganisha sifa za macroscopic na pathojeni zinazowezekana na mifumo ya uchafuzi.
Vibadilishaji vya kabla ya uchambuzi na kukataa sampuliSheria za kukusanya na incubation ya seti za utamaduni wa damuUchaguzi wa media za subculture na mifumo ya kuwekaKusoma sahani na kutambua utamaduni mchanganyikoIshara za morphology ya koloni kwa pathojeni za kawaidaSomo 5Mbinu za phenotypic za haraka na vipimo vya immunochromatographic kwa carbapenemases za kawaidaSehemu hii inalenga ugunduzi wa phenotypic wa haraka wa carbapenemase, ikijumuisha anuwai za Carba NP na vipimo vya immunochromatographic lateral flow, na mkazo juu ya sifa za utendaji, kuunganisha mtiririko wa kazi, na tafsiri ya matokeo katika muktadha wa kliniki.
Kanuni za vipimo vya phenotypic vya haraka vya carbapenemaseCarba NP na derivatives: usanidi na kusomaVipimo vya immunochromatographic kwa KPC, NDM, OXA-48Hassas, maalum, na usumbufu wa kawaidaMatumizi ya algorithmic na utamaduni na vipimo vya kimolekuliSomo 6Mbinu za utambuzi wa kiumbe: paneli za biochemical, mtiririko wa kazi wa MALDI-TOF MS na tafsiriSehemu hii inachunguza mikakati kuu ya utambuzi wa kiumbe, ikijumuisha paneli za biochemical na MALDI-TOF MS, ikishughulikia maandalizi ya sampuli, mtiririko wa kazi ya chombo, tafsiri ya spectral, utatuzi wa matatizo, na kuunganisha na mifumo ya taarifa ya maabara.
Muundo na tafsiri ya paneli za utambuzi wa biochemicalMaandalizi ya sampuli ya MALDI-TOF kwa bakteria na chachuVigezo vya upatikanaji na udhibiti wa ubora wa spectralKulinganisha hifadhidata, pointi za kupunguza alama, na kuripotiMatatizo ya kawaida na utatuzi wa ID isiyo ya makubalianoSomo 7Vipimo vya phenotypic kwa ugunduzi wa upinzani: vipimo vya uthibitisho vya ESBL, modified Hodge test, Carba NP / mCIM / sCIM kwa carbapenemases, screening ya AmpCSehemu hii inachunguza vipimo vya phenotypic kwa upinzani, ikijumuisha vipimo vya uthibitisho vya ESBL, screening ya AmpC, na vipimo vya carbapenemase kama mCIM, sCIM, na Carba NP, na mwongozo juu ya algorithms na tafsiri ya mifumo ngumu.
Screening ya ESBL na vipimo vya ushirikiano vya uthibitishoUgunduzi wa phenotypic wa AmpC ya plasmid-mediatedMtiririko wa kazi wa mCIM na sCIM na tafsiriCarba NP na vipimo vinavyohusiana na carbapenemaseKuunganisha matokeo ya phenotypic na genotypicSomo 8Mtiririko wa kazi wa kimolekuli: vipimo vya PCR vililolengwa kwa blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, methyltransferases za 16SSehemu hii inashughulikia mtiririko wa kazi wa kimolekuli kwa jeni kuu za upinzani, ikifafanua muundo wa vipimo, udhibiti, na tafsiri kwa blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, na methyltransferases za 16S, pamoja na kuunganisha na data za unyonyaji za phenotypic.
Muundo wa primer na probe kwa malengo ya upinzaniMbinu za kuondoa DNA na udhibiti wa kizuiziMkakati wa vipimo vya PCR vya singleplex dhidi ya multiplexTafsiri ya matokeo na kikomo cha ugunduziKusawazisha matokeo ya PCR na phenotypic za ASTSomo 9Kutafsiri MICs na pointi za kuvunja: tofauti za CLSI dhidi ya EUCAST na jinsi ya kuchagua pointi sahihi za kuvunjaSehemu hii inaeleza tafsiri ya MIC kwa kutumia pointi za kuvunja za CLSI na EUCAST, ikiangazia tofauti za dhana, sasisho, pointi za kuvunja maalum za kipimo, na mikakati ya kuchagua na kuandika viwango sahihi katika maabara za kliniki.
Dhana za MIC, ECOFFs, na pointi za kuvunja za klinikiTofauti kuu kati ya CLSI na EUCASTPointi za kuvunja maalum za kipimo na tovuti ya maambukiziKusasisha na udhibiti wa toleo la viwangoKuandika chaguzi za pointi za kuvunja katika maabara
