Pelajaran 1Kaedah ujian kerentanan antimikrob (AST): penyebaran cakera, mikroencaman kaldu, sistem AST automatik — kelebihan, had, bila menggunakan setiap satuBahagian ini membandingkan penyebaran cakera, mikroencaman kaldu, jalur gradien, dan sistem AST automatik, menekankan pemilihan ujian, persediaan, pembacaan, kawalan kualiti, dan mengenali mekanisme rintanan yang mungkin terlepas oleh kaedah tertentu.
Persediaan, pembacaan dan had penyebaran cakeraMikroencaman kaldu dan penentuan MICJalur penyebaran gradien: kegunaan dan amaranPlatform AST automatik dan peraturan amaranMemilih kaedah AST untuk organisma khasPelajaran 2Kawalan kualiti, pengesahan, dan pertimbangan bioselamat untuk ujian molekularBahagian ini menggariskan kawalan kualiti, pengesahan, dan bioselamat untuk ujian molekular, termasuk pengesahan esei baru, QC rutin, pencegahan pencemaran, pemisahan aliran kerja, dan pematuhan standard peraturan dan akreditasi.
Pengesahan dan pengesahan esei PCR baruKawalan dalaman, luaran, dan kecekapanMencegah pencemaran amplicon dan bawa-atasAliran kerja searah dan zon makmalKeperluan peraturan dan akreditasiPelajaran 3Pendekatan generasi seterusnya: penjujukan amplicon disasarkan, langkah paip baris penjujukan genom penuh (WGS), pemasangan, anotasi, panggilan gen rintananBahagian ini memperkenalkan penjujukan generasi seterusnya untuk pengawasan rintanan, menggariskan aliran kerja amplicon disasarkan, persediaan perpustakaan WGS, penjujukan, pemasangan, anotasi, panggilan gen rintanan, dan langkah kawalan kualiti dan pengurusan data asas.
Reka bentuk amplicon disasarkan dan persediaan perpustakaanPersediaan perpustakaan WGS, pengindeksan, dan persediaan larianKawalan kualiti baca dan pilihan pemasangan genomAnotasi genom dan pangkalan data gen rintananMelaporkan penemuan NGS dan kerelevanan klinikalPelajaran 4Pengendalian spesimen dan kultur: set kultur darah, pemanjangan, media subkultur dan petunjuk morfologi koloniBahagian ini menerangkan amalan terbaik untuk penerimaan spesimen, pengumpulan dan pemanjangan kultur darah, teknik subkultur, dan tafsiran morfologi koloni, menghubungkan ciri makroskopik dengan patogen yang mungkin dan corak pencemaran.
Pemboleh ubah pra-analitik dan penolakan spesimenPeraturan pengumpulan dan pemanjangan set kultur darahPemilihan media subkultur dan corak inokulasiMembaca plat dan mengenali kultur campuranPetunjuk morfologi koloni kepada patogen biasaPelajaran 5Kaedah fenotipik pantas dan esei imunokromatografi untuk karbapenemase biasaBahagian ini memberi tumpuan kepada pengesanan karbapenemase fenotipik pantas, termasuk varian Carba NP dan esei aliran lateral imunokromatografi, dengan penekanan kepada ciri prestasi, integrasi aliran kerja, dan tafsiran hasil dalam konteks klinikal.
Prinsip esei karbapenemase fenotipik pantasCarba NP dan turunan: persediaan dan pembacaanUjian imunokromatografi untuk KPC, NDM, OXA-48Kepekaan, kekhususan, dan gangguan biasaPenggunaan algoritma dengan kultur dan ujian molekularPelajaran 6Kaedah pengenalpastian organisma: panel biokimia, aliran kerja dan tafsiran MALDI-TOF MSBahagian ini mengkaji semula strategi pengenalpastian organisma utama, termasuk panel biokimia dan MALDI-TOF MS, merangkumi persediaan sampel, aliran kerja instrumen, tafsiran spektrum, penyelesaian masalah, dan integrasi dengan sistem maklumat makmal.
Reka bentuk dan tafsiran panel pengenalpastian biokimiaPersediaan sampel MALDI-TOF untuk bakteria dan yisParameter pemerolehan dan kawalan kualiti spektrumPencocokan pangkalan data, pemotongan skor, dan pelaporanMasalah biasa dan penyelesaian ID tidak selarasPelajaran 7Esei fenotipik untuk pengesanan rintanan: ujian pengesahan ESBL, ujian Hodge diubah suai, Carba NP / mCIM / sCIM untuk karbapenemase, saringan AmpCBahagian ini mengkaji semula esei fenotipik untuk rintanan, termasuk ujian pengesahan ESBL, saringan AmpC, dan esei karbapenemase seperti mCIM, sCIM, dan Carba NP, dengan panduan mengenai algoritma dan tafsiran corak kompleks.
Saringan ESBL dan ujian sinergi pengesahanPengesanan fenotipik AmpC berasaskan plasmidAliran kerja dan tafsiran mCIM dan sCIMCarba NP dan esei karbapenemase berkaitanMengintegrasikan penemuan fenotipik dan genotipikPelajaran 8Aliran kerja molekular: esei PCR disasarkan untuk blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, metiltransferase 16SBahagian ini merangkumi aliran kerja molekular untuk gen rintanan utama, mengperincikan reka bentuk esei, kawalan, dan tafsiran untuk blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, dan metiltransferase 16S, ditambah integrasi dengan data kerentanan fenotipik.
Reka bentuk primer dan probe untuk sasaran rintananKaedah pengekstrakan DNA dan kawalan perencatanStrategi esei PCR tunggal vs multipelTafsiran hasil dan had pengesananMenyelesaikan hasil PCR dengan fenotip ASTPelajaran 9Mentafsir MIC dan titik henti: perbezaan CLSI vs EUCAST dan cara memilih titik henti yang sesuaiBahagian ini menerangkan tafsiran MIC menggunakan titik henti CLSI dan EUCAST, menyerlahkan perbezaan konseptual, kemas kini, titik henti khusus dos, dan strategi untuk memilih dan mendokumentasikan standard yang sesuai dalam makmal klinikal.
Konsep MIC, ECOFF, dan titik henti klinikalPerbezaan utama antara CLSI dan EUCASTTitik henti khusus dos dan tapak jangkitanKemas kini dan kawalan versi standardMendokumentasikan pilihan titik henti dalam makmal
