שיעור 1זיהוי ואישור ליסטריה (L. monocytogenes): פרוטוקולי העשרה (half-Fraser/Fraser), אגרים סלקטיביים (Oxford, PALCAM, ALOA), אישור ביוכימי ומולקולריחלק זה מכסה בדיקות ליסטריה וליסטריה מונוציטוגנס בתוצרת, מפרט תוכניות העשרה עם מרקי half-Fraser ו-Fraser, בחירות אגר סלקטיבי ואישור ביוכימי ומולקולרי להבחנה בין זנים פתוגניים לשאר הליסטריה.
Sample enrichment in half-Fraser and Fraser brothsUse of Oxford, PALCAM and ALOA agarsTypical Listeria colony morphology and selectionBiochemical confirmation and species differentiationMolecular confirmation and serogrouping optionsשיעור 2שמרים ועובש: מדיות (Sabouraud Dextrose Agar, DRBC), אינקובציה (25°C, 3–5 ימים), זיהוי מושבות והבחנה מחיידקיםחלק זה עוסק בספירת שמרים ועובש על תוצרת טרייה, מתמקד במדיות מתאימות, תנאי אינקובציה והכרה במושבות פטרייתיות, תוך הבחנה מצמיחה חיידקית ופרשנות ספירות לאיכות מוצר.
Selection of Sabouraud and DRBC mediaSample dilution and spread or pour platingIncubation at 25°C and reading after 3–5 daysRecognition of yeast versus mold colony featuresDifferentiation of fungi from bacterial coloniesשיעור 3קוליפורמים ו-E. coli: מדיות סלקטיביות (Violet Red Bile Glucose, VRBG; TBX; אגרים כרומוגניים), Most Probable Number (MPN) לעומת פלטה ישירה, תנאי אינקובציה ואישור ביוכימיחלק זה מפרט בדיקות לקוליפורמים ול-E. coli בתוצרת, משווה MPN ופלטה ישירה, מתאר מדיות סלקטיביות וכרומוגניות, תנאי אינקובציה ואישור ביוכימי להבחנה בין אורגניזמים מטרה מפלורה רקע.
Use of VRBG, TBX and chromogenic agarsMost Probable Number versus direct platingIncubation temperatures and times for indicatorsTypical colony colors and morphology on mediaBiochemical confirmation of E. coli and coliformsשיעור 4בטחת איכות בבדיקות: אימות שיטה, בקרים (חיובי, שלילי, ריק), בדיקות כשירות, גבול זיהוי וכימות, קריטריונים לבדיקה חוזרתחלק זה מתמקד בבטחת איכות בבדיקות מיקרוביולוגיות, כולל אימות ואימות שיטות, שימוש שגרתי בבקרים, בדיקות כשירות, קביעת גבולות זיהוי ואמות מידה לבדיקה חוזרת או אישור.
Method validation and verification requirementsUse of positive, negative and blank controlsInternal quality control charts and trendsParticipation in proficiency testing schemesLimit of detection and repeat testing rulesשיעור 5ספירה אירובית כוללת (TAC/TVC): בחירת מדיות (Plate Count Agar, PCA), דילולים סדרתיים, תנאי אינקובציה (30–37°C, 48–72 שעות), ספירת מושבות וחישוב CFU/gחלק זה מסביר בדיקת ספירת אירובי כוללת (TAC/TVC) לתוצרת, כולל בחירת מדיות, סכמות דילול סדרתי, פרמטרי אינקובציה, כללי ספירת מושבות וחישוב ודיווח CFU לגרם להערכת עומס מיקרוביאלי כולל.
Choosing Plate Count Agar and related mediaPreparing serial decimal dilutions of samplesIncubation temperature and time selectionColony counting rules and plate acceptanceCalculating and reporting CFU per gram resultsשיעור 6זיהוי ואישור סלמונלה: העשרה מקדימה, העשרה סלקטיבית (RV, MKTTn), אגרים סלקטיביים (XLD, BGA), אישור סרולוגי וביוכימי וחלופות PCRחלק זה מסביר זיהוי סלמונלה בתוצרת טרייה, מהעשרה מקדימה והעשרה סלקטיבית דרך פלטה על אגרים סלקטיביים, ואישור סרולוגי וביוכימי והערכת שיטות PCR חלופיות.
Sample preparation and non-selective pre-enrichmentSelective enrichment in RV and MKTTn brothsPlating on XLD, BGA and other selective agarsBiochemical and serological confirmation workflowPCR and real-time PCR alternatives for Salmonellaשיעור 7שיטות מהירות וחלופות: PCR נוכחות/היעדר, אימונואסאי זרם צדדי, מערכות אוטומטיות (BacT/ALERT, TEMPO), יתרונות/חסרונות וציפיות אימותחלק זה מציג שיטות מיקרוביולוגיות מהירות לתוצרת טרייה, כולל PCR נוכחות/היעדר, אימונואסאים זרם צדדי ומערכות תרבית אוטומטיות, ומדווח על יתרונות, מגבלות, צורכי אימות ושילוב בבדיקות שגרתיות.
Principles of presence or absence PCR assaysLateral flow immunoassay formats and useAutomated systems such as BacT/ALERT and TEMPOComparison with conventional culture methodsValidation, verification and performance criteriaשיעור 8זרימת עבודה במעבדה ובטיחות ביולוגית: קבלת דגימה, ניקוי, זרימה חד כיוונית, ציוד מגן, טיפול בפסולת, אחסון פתוגניםחלק זה מתאר זרימת עבודה ובטיחות ביולוגית במעבדה מיקרוביולוגית לבדיקות תוצרת, מדגיש קבלת דגימה ורישום, ניקוי, תנועה חד כיוונית, ציוד מגן מתאים, טיפול בפסולת ואמצעי אחסון לפתוגנים בבטחה.
Sample receipt, logging and storage conditionsUnidirectional workflow and area separationUse of PPE and hand hygiene practicesSurface decontamination and spill responseWaste segregation, treatment and disposal