Lektion 1Antimikrobiell känslighetstestning (AST)-metoder: skivdiffusion, buljongmikrodilution, automatiserade AST-system — fördelar, begränsningar, när varje ska användasDenna sektion jämför skivdiffusion, buljongmikrodilution, gradientremsor och automatiserade AST-system, med betoning på testval, uppställning, läsning, kvalitetskontroll och igenkänning av resistensmekanismer som kan missas av specifika metoder.
Skivdiffusionsuppställning, läsning och begränsningarBuljongmikrodilution och MIC-bestämningGradientdiffusionsremsor: användning och varningarAutomatiserade AST-plattformar och varningsreglerVälja AST-metoder för speciella organismerLektion 2Kvalitetskontroll, validering och biosäkerhetsöverväganden för molekylärtestningDenna sektion beskriver kvalitetskontroll, validering och biosäkerhet för molekylärtestning, inklusive verifiering av nya analyser, rutinmässig QC, förebyggande av kontaminering, arbetsflödesseparation och efterlevnad av regulatoriska och ackrediteringsstandarder.
Verifiering och validering av nya PCR-analyserInterna, externa och provfähighetskontrollerFörebygga amplikon-kontaminering och carryoverEnkelriktat arbetsflöde och labbzonindelningRegulatoriska och ackrediteringskravLektion 3Nästa generationsmetoder: riktad amplikonsekvensering, helgenomsekvensering (WGS) arbetsflödessteg, montering, annotering, resistensgencallningDenna sektion introducerar nästa generationssekvensering för resistensövervakning, beskriver riktade amplikonarbetsflöden, WGS-biblioteksberedning, sekvensering, montering, annotering, resistensgencallning och grundläggande kvalitetskontroll och databehandling.
Riktad amplikondesign och biblioteksberedningWGS-biblioteksberedning, indexering och köruppställningLäs-kvalitetskontroll och val av genommonteringGenomannotering och resistensgendatabaserRapportering av NGS-resultat och klinisk relevansLektion 4Provhantering och odling: blodkultursatser, inkubation, subkulturmedia och kolonimorfologiska ledtrådarDenna sektion förklarar bästa praxis för mottagande av prover, blodkultursamling och inkubation, subkulturtekniker och tolkning av kolonimorfologi, genom att koppla makroskopiska egenskaper till troliga patogener och kontamineringsmönster.
Pre-analytiska variabler och provavvisningBlodkultursatsamling och inkubationsreglerSubkulturmedieval och inoculeringsmönsterLäsning av plattor och igenkänning av blandade kulturerKolonimorfologiska ledtrådar till vanliga patogenerLektion 5Snabb fenotypiska metoder och immunokromatografiska analyser för vanliga karbapenemaserDenna sektion fokuserar på snabb fenotypisk karbapenemasdetektion, inklusive Carba NP-varianter och immunokromatografiska laterala flödesanalyser, med betoning på prestandaegenskaper, arbetsflödesintegration och tolkning av resultat i kliniskt sammanhang.
Principier för snabba fenotypiska karbapenemasanalyserCarba NP och derivat: uppställning och utläsningImmunokromatografiska tester för KPC, NDM, OXA-48Känslighet, specificitet och vanliga interferenserAlgoritmisk användning med odling och molekylära testerLektion 6Organismidentifieringsmetoder: biokemiska paneler, MALDI-TOF MS-arbetsflöde och tolkningDenna sektion granskar stora organismidentifieringsstrategier, inklusive biokemiska paneler och MALDI-TOF MS, täcker provberedning, instrumentarbetsflöde, spektraltolkning, felsökning och integration med laboratoriedatorsystem.
Design och tolkning av biokemiska identifieringspanelerMALDI-TOF provberedning för bakterier och jästFörvärvsparametrar och spektralkvalitetskontrollDatabas-matchning, poänggränser och rapporteringVanliga fallgropar och lösning av diskordanta ID:nLektion 7Fenotypiska analyser för resistensdetektion: ESBL-bekräftande tester, modifierad Hodge-test, Carba NP / mCIM / sCIM för karbapenemaser, AmpC-screeningDenna sektion granskar fenotypiska analyser för resistens, inklusive ESBL-bekräftande tester, AmpC-screening och karbapenemasanalyser som mCIM, sCIM och Carba NP, med vägledning om algoritmer och tolkning av komplexa mönster.
ESBL-screening och bekräftande synergitesterFenotypisk detektion av plasmidmedierat AmpCmCIM- och sCIM-arbetsflöden och tolkningCarba NP och relaterade karbapenemasanalyserIntegrera fenotypiska och genotypiska fyndLektion 8Molekylära arbetsflöden: riktade PCR-analyser för blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr, 16S-metyltransferaserDenna sektion täcker molekylära arbetsflöden för nyckelresistensgener, beskriver analysdesign, kontroller och tolkning för blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like, qnr och 16S-metyltransferaser, plus integration med fenotypiska känslighetsdata.
Primer- och probdesign för resistensmålDNA-extraktionsmetoder och inhiberingskontrollSingleplex vs multiplex PCR-analysstrategierResultattolkning och detektionsgränsFörsona PCR-resultat med AST-fenotyperLektion 9Tolka MIC och brytpunkter: CLSI vs EUCAST-skillnader och hur man väljer lämpliga brytpunkterDenna sektion förklarar MIC-tolkning med CLSI- och EUCAST-brytpunkter, belyser konceptuella skillnader, uppdateringar, dos-specifika brytpunkter och strategier för att välja och dokumentera lämpliga standarder i kliniska laboratorier.
MIC-koncept, ECOFFs och kliniska brytpunkterViktiga skillnader mellan CLSI och EUCASTDos-specifika och infektionsplatsbrytpunkterUppdatering och versionskontroll av standarderDokumentera brytpunktsval i labbet